Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif2Q8C0Y1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif2Q8C0Y1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif2Q8C0Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms