Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup54Q8BTS4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup54Q8BTS4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup54Q8BTS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup54Q8BTS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms