Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Snapc4Q8BP86 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snapc4Q8BP86 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms