Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt2aQ8BNV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt2aQ8BNV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt2aQ8BNV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt2aQ8BNV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms