Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem260Q8BMD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem260Q8BMD6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms