Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnrc6bQ8BKI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms