Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
6820408C15RikQ8BJX2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
6820408C15RikQ8BJX2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms