Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd3Q8BHD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd3Q8BHD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms