Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp4f39Q8BGU0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms