Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pld4Q8BG07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pld4Q8BG07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pld4Q8BG07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms