Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.2Q85ZW9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M10.2Q85ZW9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms