Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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