Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39bQ810L4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39bQ810L4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39bQ810L4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms