Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z37

Topors, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporsQ80Z37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ToporsQ80Z37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ToporsQ80Z37 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ToporsQ80Z37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms