Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TdrkhQ80VL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TdrkhQ80VL1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TdrkhQ80VL1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms