Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otop3Q80UF9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otop3Q80UF9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms