Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rpap1Q80TE0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpap1Q80TE0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpap1Q80TE0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpap1Q80TE0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpap1Q80TE0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms