Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2lQ7TS74 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms