Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc93Q7TQK5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc93Q7TQK5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc93Q7TQK5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc93Q7TQK5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms