Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SugctQ7TNE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SugctQ7TNE1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SugctQ7TNE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms