Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Syne1Q6ZWR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne1Q6ZWR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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