Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb10Q6XAR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb10Q6XAR7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb10Q6XAR7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms