Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl3Q6W5C0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl3Q6W5C0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms