Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ift172Q6VH22 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ift172Q6VH22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ift172Q6VH22 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ift172Q6VH22 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms