Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr13Q6R5N8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr13Q6R5N8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr13Q6R5N8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms