Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4Q6PHQ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4Q6PHQ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc4Q6PHQ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4Q6PHQ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms