Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb40Q6PCS8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb40Q6PCS8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms