Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Papd7Q6PB75 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd7Q6PB75 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd7Q6PB75 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd7Q6PB75 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms