Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slf2Q6P9P0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slf2Q6P9P0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slf2Q6P9P0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slf2Q6P9P0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms