Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smchd1Q6P5D8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smchd1Q6P5D8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smchd1Q6P5D8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms