Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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