Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn12Q6JVL5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn12Q6JVL5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn12Q6JVL5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms