Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScapQ6GQT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ScapQ6GQT6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScapQ6GQT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms