Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rftn1Q6A0D4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rftn1Q6A0D4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rftn1Q6A0D4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rftn1Q6A0D4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms