Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Thsd7aQ69ZU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Thsd7aQ69ZU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Thsd7aQ69ZU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Thsd7aQ69ZU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms