Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3rf1Q69ZI1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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