Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg9aQ68FE2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg9aQ68FE2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms