Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrp9cQ66X01 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp9cQ66X01 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9cQ66X01 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms