Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn1Q64347 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clcn1Q64347 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clcn1Q64347 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms