Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou4f3Q63955 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou4f3Q63955 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms