Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa13Q62424 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa13Q62424 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa13Q62424 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa13Q62424 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa13Q62424 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa13Q62424 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa13Q62424 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa13Q62424 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms