Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddr2Q62371 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddr2Q62371 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddr2Q62371 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddr2Q62371 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms