Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd180Q62192 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd180Q62192 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd180Q62192 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms