Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttf1Q62187 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ttf1Q62187 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ttf1Q62187 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ttf1Q62187 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ttf1Q62187 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf1Q62187 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ttf1Q62187 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf1Q62187 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms