Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MslnQ61468 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MslnQ61468 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MslnQ61468 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MslnQ61468 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MslnQ61468 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MslnQ61468 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms