Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp49aQ61450 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp49aQ61450 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp49aQ61450 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms