Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcf12Q61286 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcf12Q61286 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcf12Q61286 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcf12Q61286 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms