Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcd2Q61285 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd2Q61285 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcd2Q61285 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd2Q61285 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd2Q61285 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms