Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd6Q61003 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd6Q61003 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd6Q61003 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd6Q61003 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms