Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vdac3Q60931 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vdac3Q60931 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vdac3Q60931 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms